| # | 學校名稱 | 類型 | 委辦 | 鄉鎮市區 | 備註 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 民和國中 | 偏遠地區 | 是 | 番路鄉 | 含分班分校 |
| 2 | 梅山國中 | 偏遠地區 | 是 | 梅山鄉 | |
| 3 | 竹崎高中國中部 | 一般地區 | 是 | 竹崎鄉 | |
| 4 | 昇平國中 | 偏遠地區 | 是 | 竹崎鄉 | |
| 5 | 阿里山國中小國中部 | 特偏地區 | 是 | 阿里山鄉 | |
| 6 | 豐山實驗教育學校國中部 | 特偏地區 | 是 | 阿里山鄉 | |
| 7 | 中埔國中 | 一般地區 | 是 | 中埔鄉 | |
| 8 | 大埔國中小國中部 | 特偏地區 | 是 | 大埔鄉 | |
| 9 | 水上國中 | 一般地區 | 是 | 水上鄉 | |
| 10 | 忠和國中 | 偏遠地區 | 是 | 水上鄉 | |
| 11 | 鹿草國中 | 一般地區 | 是 | 鹿草鄉 | |
| 12 | 永慶高中國中部 | 一般地區 | 是 | 太保市 | |
| 13 | 太保國中 | 一般地區 | 是 | 太保市 | |
| 14 | 嘉新國中 | 一般地區 | 是 | 太保市 | |
| 15 | 朴子國中 | 一般地區 | 是 | 朴子市 | |
| 16 | 東石國中 | 一般地區 | 是 | 朴子市 | |
| 17 | 東榮國中 | 偏遠地區 | 是 | 東石鄉 | |
| 18 | 六嘉國中 | 偏遠地區 | 是 | 六腳鄉 | |
| 19 | 新港國中 | 一般地區 | 是 | 新港鄉 | |
| 20 | 民雄國中 | 一般地區 | 是 | 民雄鄉 | |
| 21 | 大吉國中 | 偏遠地區 | 是 | 民雄鄉 | |
| 22 | 大林國中 | 一般地區 | 是 | 大林鎮 | |
| 23 | 溪口國中 | 偏遠地區 | 是 | 溪口鄉 | |
| 24 | 義竹國中 | 偏遠地區 | 是 | 義竹鄉 | |
| 25 | 布袋國中 | 偏遠地區 | 是 | 布袋鎮 | |
| 26 | 過溝國中 | 偏遠地區 | 是 | 布袋鎮 |